Honda dan Joan Mir hampir saja membuat kejutan dengan merebut pole position di MotoGP Jepang 2025 sebelum Francesco Bagnaia mengambil alih di saat akhir kualifikasi dua di Sirkuit Motegi pada Sabtu (27/9/2025). Awalnya, Pedro Acosta mengalami masalah teknis yang membuatnya harus kembali ke pit lebih awal. Meskipun Marc Marquez sempat mencatatkan waktu tercepat di awal kualifikasi dua, namun posisi pertama cepat direbut oleh Bagnaia. Alex Marquez terpuruk di posisi delapan awal kualifikasi dua, sementara Fabio Quartararo berada di urutan tiga di belakang Bagnaia dan Marc Marquez. Setelah istirahat sejenak di pit, Marc Marquez berhasil kembali ke posisi pertama sebelum akhirnya Joan Mir secara mengejutkan mencatat waktu tercepat. Namun, harapan Honda dan Mir untuk meraih pole position pertama di MotoGP 2025 pupus setelah Bagnaia kembali menunjukkan performa terbaiknya di akhir sesi kualifikasi dua.
